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如何精確測(cè)定AAV病毒載體空殼率?

如何精確測(cè)定AAV病毒載體空殼率?
貝克曼庫(kù)爾特生命科學(xué)  2020-10-16  |  閱讀:5136

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如何精確測(cè)定AAV病毒載體空殼率?

 

重組腺相關(guān)病毒(AAV)作為病毒載體,具有安全性好、特異性強(qiáng)、遞送效率高等特點(diǎn),為新的、挽救生命的基因治療方法帶來(lái)巨大的希望。但是,雖然電鏡等技術(shù)可以表征AAV的均一性和聚集狀態(tài),但它們沒(méi)有足夠的分辨率來(lái)準(zhǔn)確定量病毒顆粒的均一性和有效載量。而解決這一問(wèn)題的方案是:使用分析型超速離心技術(shù)(AUC)表征AAV病毒顆粒特性。

 

正如基因治療研究人員所知道的那樣,在早期產(chǎn)品開(kāi)發(fā)中有非常多的風(fēng)險(xiǎn),快速檢測(cè)產(chǎn)品質(zhì)量是至關(guān)重要的。但到目前為止,使用之前的技術(shù)來(lái)檢測(cè)臨床級(jí)的重組AAV載體仍然是不現(xiàn)實(shí)的。

·  qPCR/ELISA、光密度法均為間接檢測(cè)方法,結(jié)果只能用于樣品間的對(duì)比,而無(wú)法準(zhǔn)確定量

·  電子顯微鏡可以在視野中看到空殼顆粒與實(shí)心顆粒,但無(wú)法確定包含所DNA是否完整,同時(shí)也無(wú)法定量

·   離子交換色譜法面臨分辨率不夠、不同血清型病毒顆粒不適用于同一種分析方法等問(wèn)題

完整的AAV衣殼和相關(guān)的衣殼雜質(zhì)

 

因此,主要的障礙是缺乏高分辨率、可用于定量的技術(shù)來(lái)監(jiān)測(cè)病毒顆粒產(chǎn)物特性,比如:

·   均一性

·   純度

·   批次一致性

·   病毒有效載量

使用分析型超速離心技術(shù)(AUC)表征AAV病毒顆粒的特性,可以幫助精準(zhǔn)測(cè)定AAV病毒載體空殼率!

分析型超速離心技術(shù)(Analytical Ultracentrifugation,AUC)是表征生物大分子特性、研究生物分子理化性質(zhì)的主要技術(shù)手段之一,用于分析樣品異質(zhì)性、聚集體的形成以及分子間相互作用等。貝克曼推出的Optima AUC分析型超速離心機(jī)由主機(jī)、光學(xué)系統(tǒng)、轉(zhuǎn)頭以及樣本池組件等構(gòu)成,可以想象成是一臺(tái)制備型超速離心機(jī)和光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)的結(jié)合,但不同于制備型離心機(jī),Optima AUC作為分析型儀器可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)樣品沉降過(guò)程中溶質(zhì)濃度隨時(shí)間和距離的改變,從而計(jì)算得到分子特性。

 

Optima AUC與AAV樣品檢測(cè)結(jié)果示意圖

 

依據(jù)溶液中空殼、實(shí)心、中間產(chǎn)物等不同狀態(tài)病毒載體的沉降系數(shù)的不同,AUC分析得到的c(s)分布可以表征AAV病毒載體特性。并且在檢測(cè)過(guò)程中使樣品不接觸任何基質(zhì)、不使用任何標(biāo)準(zhǔn)品與標(biāo)記物,直接檢測(cè)溶液中AAV病毒顆粒特性。AUC可以幫助研究人員:

ü  定量檢測(cè),精確測(cè)定病毒載體有效載量或空殼率。

ü  可以表征生產(chǎn)過(guò)程中的產(chǎn)物,幫助確定去除空顆粒的方法。

ü  可以監(jiān)測(cè)AAV載體結(jié)構(gòu)的異質(zhì)性、聚集狀態(tài)。

ü  可以區(qū)分、量化樣品中的多個(gè)組分,包括空病毒顆粒、包含全基因組病毒顆粒、包含部分基因組病毒載體、載體碎片、基因組碎片等。

ü  根據(jù)不同血清型的AAV載體,對(duì)轉(zhuǎn)入基因的大小和單/雙鏈狀態(tài)進(jìn)行定量。


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